水蛭养殖雌雄同体，雄性生殖器官有精巢10对，各有输精小管通人腹神经索两侧的输精管，输精管由后向前平行延伸至前端睁膨大的贮精囊，再到细的射精管然后进入阴茎，在射精管的细笺管汇入膨腔处的壁上有疏松的前列腺，其分泌物可包囊精子。
雌性生殖器官有卵巢一对，由两条输卵管在第Ⅺ节内会合成总输卵管，通入膨大的阴道末端，开口于雌孔。