无论采取何种贮藏方法，只要既可防止水蛭腐败变质，又可防止虫蛀的方法都可使用。
1．缸、瓮贮藏法
传统贮藏一般多采用缸、瓮等器皿，贮藏时可在缸、瓮等的底部放入干燥的可吸湿防潮的石灰，再隔一层透气的隔板或两层滤纸，将水蛭的干品放入，加盖保存即可。缸、瓮口最好密封，防止蛀虫进入啃食。
2．塑料袋贮藏法
现代贮藏法一般采用现代化的手段，多用特制塑料袋，每袋重量可分为2千克、5千克等，配以真空防潮等手段，既可防止水蛭腐败变质，又可防止虫蛀。